La douane installe ses bureaux dans l’avant-port de Saint-Malo, sur le quai Saint-Vincent en 1841. On y enregistre les marchandises à l’export, essentiellement alimentaires : beurre, œufs, pommes de terre, fruits, volailles, animaux de boucherie, orge, cidre, morue, mais aussi laine, toiles à voile, bois, fer, plomb, cuivre, tabac et, à l’import : charbon, vin, bois.

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Le bâtiment perd sa fonction au milieu du 20ème siècle, remplacé par de nouvelles douanes  le long du bassin à flot Duguay-Trouin, mais il ne sera rasé qu’en 1981 lors de l’aménagement du parking devant les remparts.